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martes :: 26 de noviembre de 2002
 
 
> e-coli: pedacitos de vida; la vida a pedacitos?

[pedacitos=bits]
modelo computerizado de e-coli
:: prediciendo la evolución de bacterias

Unos bio-ingenieros han utilizado su modelo informático de E-coli (pendiente de patente) para predecir exactamente cómo se desarrollarían las bacterias bajo condiciones específicas. Los resultados pueden tener aplicaciones para el diseño a medida de materiales biológicos para aplicaciones comerciales o para predecir la evolución de bacterias resistentes a drogas.

“Esto es totalmente revolucionario - que se pueda predecir realmente el resultado de un proceso tan complicado e intrincado como la evolución adaptiva - dice Bernhard Palsson, profesor de bioingeniería de la UCSD y a co-autor del estudio con Jeff Hasty, también profesor de bioingeniería de la UCSD. El estudio también sirve como ejemplo del impulso de la biología de sistemas, un campo emergente dedicado a emplear las matemáticas y la simulación computerizada para entender cómo los genes y las proteínas trabajan juntos para controlar la función celular.

Palsson creó un modelo computerizado de E-coli en el año 2000 y desde entonces ha demostrado que el modelo imita exactamente el comportamiento de las bacterias durante el 80% del tiempo. En las últimas dos décadas, Palsson ha estado trabajando en el gran desafío de crear modelos informáticos de estas funciones biológicas. Emplea una técnica que él llama modelos basados en resticciones, básicamente describiendo lo que una célula no hace, para llegar a definir lo que si puede hacer mediante un proceso de eliminación. Hasta la fecha, Palsson ha creado en modelos del metabolismo para E-coli, glóbulos rojos, H.influenzae, H.pylori y levadura.

Los investigadores están comenzando a construir y a comprobar versiones sintéticas de los módulos de control dentro del trazado conectivo de las células. Por ejemplo, Hasty ha desarrollado un modelo de loop de respuesta positiva, en el cual un gen produce una proteína que a su vez provoca que el gen devenga más activo. Dice que a medida que los científicos comiencen a sintetizar estos simples módulos de red en el contexto de modelos matemáticos, se preparara la base para el control de las funciones celulares, que podría tener usos importantes en nanotecnología y terapia genética y celular. La meta a largo plazo de Hasty es construir redes genéticas sintéticas que se pudieran insertar en las células de un paciente para regular ajustadamente la expresión de una proteína deseada, o incluso causar la autodestrucción de una célula indeseable. >de *UCSD Bioengineers Use Computer Model to Predict Evolution of Bacteria*, 20 de noviembre, 2002.

contexto relacionado
>
Worldwide E.coli alliance. 4 de septiembre, 2002

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